西晋太康三年(282)，朝廷分原乌程县西另立新县，称“长城县”，因春秋时吴王阖闾使弟夫概于此筑城，因城狭长，得名“长城”。
县以古遗址得名，属吴兴郡。
南朝宋、齐、梁、陈四朝，长城县均属吴兴郡。
隋开皇九年(589)撤长城县再入乌程县，属苏州郡；仁寿二年(602)复立长城县，属湖州。
隋末(618)江南豪强沈法兴于县境置长州，唐武德四年(621)置绥州，约六年(623)更名雉州，并以原乡县附，七年（624）废雉州，复名长城县，并以原乡、安吉两县入。
麟德元年(664)复以安吉县出。
五代属吴越国。
后梁开平四年(910)，吴越王钱镠为避后梁朱温庙讳，改长城县为长兴县。
地名含义“祈福吴越国长存兴旺”。
元至元十三年(1276)属湖州路，元元贞元年（1295）升长兴为州，称长兴州，仍属湖州路。
明太祖丁酉年（1357）更名长安州，以安吉县附，壬寅年（1362）复名长兴州，洪武二年（1369）降州为县。
清顺治二年(1645)隶湖州府。
1912年民国建立，湖州府废，直属浙江省。
1928年长兴县属第一行政督察区，1936属第二行政区。
1947年，行政区划调整，全县重组为24个乡镇级行政单位。
1949年5月16日，长兴县人民政府成立，全县设7区、26乡镇，隶浙江省第一区专员公署，1951年4月，隶嘉兴地区专员公署,1956年5月，全县行政区划调整，撤区并乡，设2镇、24乡，后乡镇级行政区划一直微调中。
1983年10月，隶湖州市。
之后1992年、1998年、2000年、2012年、2015年，长兴县实施了五次乡镇级行政区划调整合并。
截至2015年，长兴县辖雉城、画溪、太湖、龙山4街道，夹浦、洪桥、李家巷、和平、虹星桥、林城、泗安、小浦、煤山9镇，水口、吕山2乡，后行政区划不再变更。