1934年2月25日，陕甘边区革命委员会成立。
吴旗的白豹川、脚札川、小涧川、卜罗川开辟为苏区（建有人民政权的地方），属赤安县（保安）辖地。
1935年7月，定边县革命委员会在宁塞川凤凰寺建立，辖黄砭、毛砭、凤凰寺三区。
1936年6月，陕甘宁省委在今吴旗县二道川塔儿湾建立苏维埃政府（即人民政府），7月移迁洛河川刘渠子，辖杨青、新寨、水泛台、凤凰寺、黄砭五个区二十二个乡。
1937年10月撤销，为定边、靖边、志丹、甘肃安化县等分辖。
1942年7月，陕甘宁边区政府决定划定边、靖边、志丹、安化等县部分区域，设置吴旗县，隶属三边分区，辖六个区三十三个乡。
1949年10月吴旗县撤销，县域又划归原属四县。
1950年04月，陕西省人民政府命令恢复吴旗县，隶属陕北行政公署。
5月陕北行政公署撤销，吴旗县隶属延安分区。
1956年11月县政府改称县人民委员会。
1958年12月吴旗县并入志丹县。
1961年9月，吴旗县正式恢复，属延安地区。
2005年10月更名为吴起县至今。