1912年至20世纪90年代，红谷滩绝大部分为沙滩、滩涂。
1998年至2000年，为酝酿、决策和抽沙造地阶段。
2000年2月红谷滩新区开发建设总指挥部成立。
2000年7月11日，正式启动红谷滩中心区4.28平方千米的开发建设。
2001年底，南昌市行政中心竣工，市委、市人大、市政府、市政协、市纪委等部分党政机关迁入红谷滩办公。
2002年1月，新建县长堎镇、望城镇、生米镇等3镇局部划入红谷滩新区；沙井街道、蛟桥镇凤凰村和昌北农场划入。
2002年5月15日，正式成立红谷滩新区工委、管委会，为市委、市政府派出机构；2007年，南昌市又将当时的新建县生米镇安丰、富乡、斗门、渔业等4个成建制行政村以及中堡村局部，划归红谷滩新区管辖，至此，红谷滩新区面积达到了78平方千米。
2012年2月12日随着新建县生米镇（璜溪村除外）成建制划归红谷滩新区管辖，区域面积由78平方千米扩大至175平方千米。
2016年，新建区望城镇润溪村、双溪村、岭口村等7个村以及生米镇黄佩村划入沙井街道。
2018年成立卫东街道。
2019年12月25日，根据国务院《关于同意江西省调整南昌市部分行政区划的批复》(国函(2019105号)精神，成立南昌市红谷滩区，将南昌市东湖区沙井街道、卫东街道和新建区生米镇划归红谷滩区管辖，以东湖区沙井街道、卫东街道和新建区生米镇的行政区域为红谷滩区的行政区域。
2020年6月28日红谷滩区正式揭牌成立。
2022年1月新建区厚田乡划归红谷滩区管辖。