蕉岭县旧称镇平县。
春秋战国时属“百越之地”。
秦始皇三十三年（前214），秦始皇发兵平南越，设南海郡，蕉岭地属南海郡龙川县。
汉高后吕雉五年（前183），分龙川县为龙川、揭阳两县，蕉岭地属揭阳县。
三国吴（222-280），蕉岭地属东官郡，仍属揭阳县。
晋太康元年（280），改东官郡为义安郡，仍属揭阳县。
东晋咸和六年（331），蕉岭地属义安郡之海阳县。
南朝齐高帝建元元年（479），分海阳县为海阳、程乡两县，蕉岭地属程乡县。
南朝陈武帝永定元年（557），设潮州，以程乡、海阳、潮阳属之。
五代南汉乾和三年，置敬州，领程乡县。
宋太祖开宝四年（970年），改敬州为梅州，蕉岭地属梅州。
元世祖至元十九年（1282），升梅州为梅州路。
明太祖洪武二年（1369），废梅州路，复称程乡县，隶属潮州府。
明嘉靖四十三年（1564），置平远县，隶潮州。
蕉岭之置城地址古怀仁及其最富庶之石窟河平原，均属平远县地。
明崇祯六年（1633），设置镇平县，隶属潮州。
清雍正十一年（1733），升程乡为嘉应州，领平远、镇平、兴宁、长乐四县。
清嘉庆十二年（1807），嘉应州为嘉应府。
清嘉庆十七年（1812），仍改为州，是为嘉应州镇平县。
1912年，中华民国成立后，废嘉应州，镇平县隶属广东省直辖。
1914年，因河南省已先有“镇平县”，而更名为“蕉岭县”。
1949年5月14日，蕉岭县解放，6月，蕉岭县人民民主政府成立，隶属兴梅专区。
1952年，撤销兴梅专区，蕉岭县隶属粤东行政公署。
1952年8月，蕉岭与平远合县，称蕉平县。
1954年3月，蕉平分县，仍称蕉岭县。
1956年2月，成立汕头专署，撤销粤东行署。
蕉岭县改隶属汕头专区。
1958年12月，蕉岭与梅县合并，称梅县。
1961年3月，蕉梅分县，恢复蕉岭县建置。
1965年7月1日，梅县专区从汕头专区分出，成立梅县地区，蕉岭县隶属于梅县地区。
1988年1月，撤销梅县地区，成立梅州市，蕉岭县隶属梅州市管辖，一直沿用至今。