地名由来：清水土家族乡因康熙年间，刘氏家族到该地安居，建有三眼四季清澈的水塘，故此得名。
2016年12月，国家民委命名清水土家族乡为第四批全国民族团结进步创建活动示范单位。
清水土家族乡是云阳县唯一的少数民族乡，也是全县的重点贫困地区之一，位居云阳最南端，距县城64公里，与万州、奉节和湖北省利川市接壤，幅员面积102平方公里，耕地面积8386亩，其中水田4328亩，旱地4058亩。全乡辖16个村（其中“十一五”贫困村7个），211个组，4839户，18960人，2005年末全乡建卡贫困人口4836人，其中绝对贫困人口1340人，相对贫困人口3496人。其中土家族1118户，3926人，占全乡总人口的20.71%。， 2006年10月经重庆市人民0批准，将清水土家族乡和云峰乡合并为清水土家族乡。
全乡境内有国家级地质公园——龙缸风景区；市级森林公园——歧山草原；正在与万州潭獐峡联合申报的国家级风景旅游区在我乡境内也有8.2平方公里的面积，是全县自然旅游资源最集中、开发价值最高的地方。全县最大的两个招商引资项目——盖下坝水电站正在建设之中、歧山风力发电站正在筹备建设。清水土家族乡将是云阳县发展前景最好的乡镇之一。
清水土家族乡抓住岐耀山扶贫开发示范区建设契机，加强基础设施建设，积极调整产业结构，经济发展突飞猛进，人民生活水平不断提高。2008年完成固定资产投资3820万元，同比增长121.45%，人均固定资产投资额达2065元。农民人均纯收入达2913元，同比增长20.17%。完成地区生产总值6120万元， 同比增长27.02%。其中农业生产总值实现8500万元，工业生产总值达1510万元，第三产业实现产值达1210万元。社会消费品零售总额达2630万元，同比增长24.41%。
清水土家族乡主导产业发展迅速。春辉牧业公司投资500余万元建设的标准化山羊种繁场，可年提供能繁母羊3000余只，仅此一项可为我乡增加山羊存出栏量9000头以上；通过专业合作社、互助合作基金大力推行养殖小区建设，目前已建成50户以上的养殖小区16个，已借山羊1200头，可增加年出栏量近4000头；全乡养羊存栏量达20头以上的大户有176户，至今年年底可实现人均一头羊的目标。高山伏调蔬菜基地3200亩，杨树和芍药间作基地2100亩。
我乡山大坡陡，人杰地灵，是革命先辈刘孟杭、战斗英雄徐泽贵的故乡。大自然的鬼斧神工造就了我乡独特的旅游资源，神气优美的自然风景，古朴神秘的土家风情，是人民观光猎奇、休闲度假的理想之地。
历史沿革：
清末，境域属万县南岸四郭里前六甲。
1961年12月，从云龙、耀灵2公社各划出一部分大队组建成清水公社。
1984年6月，清水公社改为清水乡。
1992年9月，并入云峰乡。
1998年7月，复设清水乡。
2002年2月，清水乡改为清水土家族乡。
2006年10月，云峰乡并入清水土家族乡。
